Knjigovodstveno-financijska služba sastavlja i predočava financijske izvještaje za potrebe Poliklinike i vanjskih korisnika u obliku periodičnih obračuna i završnog računa te planira i raspolaže novcem na žiro računu. Na taj je način ona sustav potpore upravi, kao i svim zaposlenicima u pogledu davanja kvalitetnih informacija o poslovanju, s ciljem donošenja valjanih poslovnih odluka.

Veliki korak u organizaciji i modernizaciji rada službe napravljen je uvođenjem novoga i kvalitetnoga informatičkog sustava u svim djelatnostima u Poliklinici radi vođenja evidencije pruženih usluga pacijentima. Takav način praćenja evidencije omogućit će stjecanje boljeg uvida u strukturu potraživanja za pružene usluge i njihovu naplatu.